Trường Tiểu học Lý Tự Trọng thành lập theo Quyết định số 125/QĐ-UB ngày 20 tháng 7 năm 1993 của UBND Thị xã Thái Bình ( Nay là Thành phố Thái Bình) trên cơ sở tiền thân là trường Phổ thông cơ sở Lý Tự Trọng.
Trường tiểu học Lý Tự Trọng thuộc địa bàn phường Bồ Xuyên nằm ở vị trí trung tâm thành phố Thái Bình, phường vinh dự được Đảng và Nhà nớc tặng thưởng “Anh hùng lực lượng vũ trang nhân dân thời kì đổi mới”. Đảng bộ liên tục đạt danh hiệu “Trong sạch vững mạnh", có nhiều năm phường đạt danh hiệu “Đơn vị gương mẫu về mọi mặt”. Trong quá trình xây dựng và trưởng thành nhà trường luôn nhận được sự quan tâm, chỉ đạo của các Cấp uỷ Đảng, chính quyền địa phương, của Phòng Giáo dục và đào tạo thành phố Thái Bình, sự quan tâm của các bậc phụ huynh học sinh. Đặc biệt nhân dân phường Bồ Xuyên có truyền thống hiếu học, rất quan tâm đến phong trào giáo dục. Đây chính là điều kiện thuận lợi cơ bản để cán bộ,giáo viên trường Tiểu học Lý Tự Trọng phấn đấu đạt được thành tích xuất sắc trong nhiều năm qua.
Nhà trường là cơ sở giáo dục công lập của hệ thống giáo dục quốc dân, có nhiệm vụ thực hiện công tác phổ cập giáo dục tiểu học đúng độ tuổi và xóa mù chữ trong cộng đồng, tổ chức các hoạt động giáo dục và dạy học để giúp cho học sinh hình thành cơ sở ban đầu cho sự phát triển đúng đắn và lâu dài về đạo đức, trí tuệ, thẩm mỹ và các kỹ năng cơ bản để giúp học sinh tiếp tục học trung học cơ sở.
Những thành công của trường từ khi thành lập đến nay là sự kết tinh của trí tuệ và công sức của nhiều thế hệ thầy giáo, cô giáo, học sinh, sự đồng hành đầy trách nhiệm của cha mẹ học sinh và sự lãnh đạo của Đảng bộ, chính quyền các cấp; sự quan tâm chỉ đạo của Phòng GD&ĐT thành phố Thái Bình, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thái Bình.